Notion と Obsidian を併用して 4 年以上経つ。両方とも PKM (Personal Knowledge Management) ツールと括られるが、設計思想はかなり違う。Notion はページというブロックを組み合わせて構造を作るデータベース寄りのツール、Obsidian は自分のローカルディスクにある Markdown ファイルに双方向リンクを張るだけの素朴な仕組み。結論を先に書くと、チームと個人、短期と長期で使い分けるのが実用的だった。
セカンドブレインは保存するツールではなく、考えるツールである。
主要機能の比較(2026/4 時点)
| 項目 | Notion | Obsidian |
|---|---|---|
| 月額(個人) | ¥1,350(Plus) | 無料 |
| 月額(ビジネス) | ¥2,700/席 | $50/席/年 |
| オフライン編集 | 可(大規模で遅延) | 高速・安定 |
| データベース機能 | 標準搭載 | プラグインで対応 |
| 双方向リンク | 制限あり | 中核機能 |
| AI アシスト | Notion AI 統合 | 公式/3rd-party プラグイン |
| ファイル形式 | 独自(エクスポートで MD) | プレーン Markdown |
| エクスポート耐性 | 中(書式が一部失われる) | 高(ファイルそのもの) |
| 同期 | サーバ同期(標準) | Obsidian Sync 月額 $4〜 |
設計思想の違い
Notion はデータベースをページに埋め込める。タスク、書籍ログ、顧客リストなどを同じワークスペース内に構造化して持てる。ページの親子関係とプロパティで情報を整理する発想で、SaaS に慣れたチームには自然に馴染む。
Obsidian は、ユーザーの PC 上にある Markdown ファイルのフォルダに対して「ビューア兼エディタ」として動く。ファイルそのものが一次情報で、ツールは離脱できる。10 年前に書いた Markdown が 10 年後も手元のテキストファイルとして残ることが保証される点は、長期の知的作業で意味を持つ。
4 年使った実感
チーム運用では Notion を使っている。共有ページ、コメント、同時編集がすぐ機能するのは大きい。プロジェクト管理、ミーティングノート、ドキュメントの置き場としては完成度が高い。
一方、個人の研究ノート、読書記録、執筆の下書きは Obsidian に移した。双方向リンクがあると、読書メモから書いている記事へ自然に情報が流れる。紙の手帳と相性が良いのも、Markdown で書いていると後で引用しやすいから。
向かないケース。Obsidian はオンボーディングが不親切なので、PKM ツール初体験の人にはお勧めしない。まず Notion で慣れてから Obsidian を試すと、両方の良し悪しが分かる。Notion も万能ではなく、オフラインで数千ページのワークスペースを開くと動作が重くなる。2026 年時点でどちらも進化中で、1 年後の結論は変わる可能性がある。